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次世代シークエンシング(NGS)サービス
シングルセルシークエンス 受託解析サービス

シングルセルシークエンスは、バルクシークエンスと比較して、細胞の多様性について完全な複雑性を明らかにします。主に、珍しい細胞タイプ、細胞系列の関連性、ヘテロな性質のサンプルの研究に関連する複雑さを解決するために採用されます。詳細なシングルセルシークエンスを行うことで、個々の細胞の細胞機能を簡単かつ効率的に探索することができます。

チラシダウンロード(PDF)
概要

本サービスでは、10x Genomics Chromium システムと Illumina NGS プラットフォームを組み合わせることで、シングルセル遺伝子発現、シングルセル免疫プロファイリング、シングルセルATAC を含む、高品質なエンドツーエンドシングルセルソリューションとサービスを提供しています。

シングルセル遺伝子発現: ヘテロな細胞集団から各細胞における細胞の異質性、新規ターゲット、バイオマーカーをプロファイリングします。
シングルセル免疫プロファイリング: 単一細胞から、全長、ペアB細胞もしくはT細胞レセプター、抗原特異性、および遺伝子発現を解析します。
シングルセルATAC: クロマチンアクセシビリティをシングルセルレベルで解析し、細胞の種類や状態、遺伝子制御機構の理解を深めることができます。


特長

シングルセルシークエンスは、ヘテロな細胞サンプルにおけるトランスクリプトームの多様性を明らかにすることを意図しています。3' および 5' 遺伝子発現に関する深い洞察を提供し、シングルセルの解像度で細胞の違いを特徴づけます。
この分野での最新技術、10x Genomics Chromium システムおよび Illumina NGS プラットフォームを活用したシングルセルシークエンスソリューションのエンドツーエンドパッケージを提供しています。ハイスループット、高精度のシングルセルシークエンスサービスを、迅速な納期でご提供します。

解析の流れ

サンプル調整、ライブラリー調製、シークエンス、データQCから、バイオインフォマティクス解析まで、高品質でプロフェッショナルなサービスを提供します。各ステップは、高い科学水準と綿密な設計に則して実施され、高品質な研究成果を保証します。

【解析ワークフロー】

 1.サンプル調整
   ↓サンプルQC

 2.シングルセルライブラリー調製
   ↓ゲルビーズエマルジョン(GEM)生成とバーコード化
   ↓GEM-RT 後の精製
   ↓cDNA 増幅
   ↓ライブラリー構築
   ↓ライブラリーQC

 3.シークエンス(Illumina, PE150)
   ↓データQC

 4.バイオインフォマティクス解析

【サービスの仕様】

シークエンスプラットフォーム Illumina NovaSeq 6000 シークエンスシステム
リード長 PE 150bp
推奨データ量 サンプルあたり生データで 50Gb
データ解析内容 ●10x シークエンスデータ処理およびQC
●高頻度で変動する遺伝子の同定
●細胞のサブポピュレーションの同定
●マーカー遺伝子の検出
●エンリッチメント解析およびマーカー遺伝子のアノテーション

【サンプル条件】

サービスタイプ サンプル量 細胞生存率
出張解析サービス 少なくとも 50,000 細胞 細胞生存率>80%
細胞サイズ<40μm
凍結細胞サービス バイアルあたり 1,000,000 細胞以上を凍結し、
少なくとも 2 本の 1.5ml クライオバイアルをお送りください。
細胞生存率>85%
細胞サイズ<40μm
*出張解析サービスは、日本国内のみ承っております。
※組織からの解析をご希望の場合にも、お問合せください。


価格



サービス名 税別価格 型番
シングルセルシークエンス解析サービス お問合せ お問合せ


ご注意事項(必ずご確認ください)

1.解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(Novogene社)にて実施されます。

2.解析に利用する製品に関して
本サービスの仕様は、事前に予告なく変更される場合があります。

3.お見積りに関して
正式なお見積書は、直接販売の場合には直接ご提出いたしますが、代理店経由の場合は代理店よりご提出いたします。

4.サンプルの送付および取り扱いに関して
4.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。サンプルは、十分量の砕いたドライアイスとともに梱包し、クール便でお送りください。
4.2 サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料は、お客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
4.3 サンプル送付の際は、QCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスには着手できませんので、ご注意ください。
4.4 ご送付頂いたサンプル品質チェックの結果、解析に必要な量が不足または低品質であった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担いただきます。
4.5 弊社に起因しない(国内および国際輸送時など)サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
4.6 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVなどに感染している検体など)は、お預かりできません。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
4.7 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
4.8 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
4.9 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。

5.キャンセルに関して
本サービスは、海外での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。

6.納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から90日間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。


*本サイトの情報はNovogene社のHomepageの情報を一部引用しております。
 
お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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