製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　 Facebook　 Twitter 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス・特許　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞DNAシークエンシング受託解析＞次世代シークエンシング（概要）＞PacBio RS ロングリード 受託解析 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング 概要 受託解析サービスの流れ QCシート 対応アプリケーション 遺伝子パネル解析 - エクソームエンリッチメント - Disease Panels - カスタムターゲットエンリッチメント トランスクリプトミクス解析 - RNA-Seq - tRNA-Seq 受託解析サービス - tRF&tiRNA-Seq 受託解析サービス エピゲノミクス解析 - ChIP-Seq - ヒト全ゲノムメチル化 - smallRNA-Seq - lncRNA-Seq - (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ゲノミクス解析 - ヒト全ゲノムシークエンシング - 新規ゲノムシークエンシング - ゲノムリシークエンシング - PacBio RS�U ロングリード メタゲノム解析 - メタゲノム - 微生物ゲノムアンプリコン Hi-Cシークエンス解析 - Proximo Hi-C Genome Scaffolding - ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 バイオインフォマティクス ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング（次世代シーケンシング）サービス PacBio RS�U ロングリード 受託解析サービス 平均4Kb以上のロングリード解析！ フィルジェンでは、PacBio RS�U（次世代シークエンサー）を用いたロングリード受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench（CLC bio社）”も販売いたしております。 概要 PacBio RS�Uは、平均リードが約4kbを実現し、リアルタイムに1分子シークエンス機能を備えた革新的な第三世代DNAシークエンサーです。これまでの次世代シークエンサーに必要とされるPCR増幅が不要で、GC含有量に関わらず幅広いゲノム領域で均一なシークエンス結果を得ることができます。微生物などの新規ゲノム解析やコンティグ配列の整列などの解析に対応可能です。 サービスの仕様 使用機種 Pacific Bioscience社 PacBio RS�U ライブラリー種類 ゲノムDNA Insert size： up to 10kb, 10-20kb 納品データ fastq, bas.h5, metadata.xml など 納期（標準） 約2ヶ月 * 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受け出来ません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製等の問題で、再度サンプルを海外メーカーへ発送する場合は、別途送料をご請求させて頂きます。 【PacBio RS�Uのライブラリー作製手順】 1. サンプルとして2本鎖DNAを準備する。 2. DNAを断片化 3. SMRTbellアダプター（ヘアピン状のアダプター)を2本鎖DNAの両端に付加。 4. アダプターの一方の末端には、DNA合成開始に必要なプライマーが付加されている。 5. 分子のDNAポリメラーゼは、ライブラリーのSMRTbellアダプターに結合し、DNA配列を順に合成していきます。 【PacBio RS�Uのシークエンスについて】 PacBio RS�Uでは、上図のSMRT Cellにサンプルをアプライし、シークエンスを行います。このSMRT Cellには、150,000のZMW(穴)があり、この中で、1分子のDNAポリメラーゼによるDNA合成を行います。右図は、ZMWの拡大図です。穴の下方に固定されているものが、1分子のDNAポリメラーゼです。ヌクレオチドが取り込まれるときに、リン酸についた蛍光が自動的に切り離され、そのときレーザーで励起されて、A,T,G,Cに特徴的な波形データが得られます。これらの反応をリアルタイムに継続的に動画として記録していきます。最大の録画時間は120分です。長い配列をリードするためには、長い録画時間が必要となります。 より長い配列が必要な場合は、インサート長を長くし、精度を上げて読みたい場合は、インサート長が短いライブラリーを選択してください。 左図：SMRT Cell　右図：ZMWの拡大図　　 必要サンプル量 サンプル ・ゲノムDNA（up to 10kb insert）：10ug以上（40ng/uL以上） ・ゲノムDNA（10-20kb insert）：20ug以上（200ng/uL以上） O.D.260/280=1.8〜2.0 O.D.260/230=1.8以上 1. 電気泳動写真を必ず添付してください。 必ず、RNase処理を行い、DNAの分解がされていないことを確認してください。 2. DNase、RNaseフリーのスクリューキャップ式の1.5mLエッペンチューブをご使用ください。 3. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、保存してください。また、高温や極端なpH環境下(＜pH6または＞ｐH9 ）にさらしたり、UV照射や蛍光標識をしない様にしてください。 4. UVスペクトルベースの方法では、RNA、dsDNA、ssDNA、フリーの核酸などの多くの核酸も同時に検出するため、ゲノムDNAの測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 5. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 価格 サービス内容 数量 税別価格 Cat.# PacBio RS�U用 ライブラリー作製サービス PacBio RS�U library(up to 10kb insert) 1サンプル お問合せ F-DL-PBLP10 PacBio RS�U library(10-20kb insert) 1サンプル お問合せ F-DL-PBLP20 PacBio RS�U用 シークエンスサービス SMRT cell sequencing  1-7 SMRT cell お問合せ F-DL-PBSC 8 SMRT cell 以上 お問合せ F-DL-PBSC-8 　 お問い合わせ　biosupport@filgen.jp　P.052-624-4388 www.filgen.jp Copyright (C) 2004-2018 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.