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*ヒト全エクソームシークエンスサービス 2017 ウィンターキャンペーン実施中!
 期間:2017/1/末まで  ⇒キャンペーンちらし(PDF)
次世代シークエンシング(次世代シーケンシング)サービス
エクソーム エンリッチメント(Exome) 受託解析サービス
フィルジェンでは、Novogene社と業務提供し、次世代シークエンスサービス/Agilent社SureSelectを用いたエクソームエンリッチメント受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。 

概要

Novogene社のエクソームエンリッチメント受託解析サービスでは、Agilent社のSureSelect Human all Exon V6キットとillumina社のHiSeq2500を使用し、効率的なエクソン領域のエンリッチメントおよび高品質な次世代シークエンスデータを取得します。
標準データ解析付きのサービスでは、充実したバイオインフォマティクス解析が含まれたHTML形式のレポートを納品します。

サービスの仕様

使用機種 illumina社 HiSeq4000
ライブラリー種類 PE150
保証データ量 ヒト/マウス: 6Gb, 12Gb
作業内容 サンプルQCチェック, エクソン領域の濃縮作業,
ライブラリー作製, シークエンス作業,
バイオインフォマティクス解析(オプション)
納品データ HDD/USB(NTFSフォーマット)にて以下のデータを納品
・シークエンスデータ(.fastq)
・解析データ(.bam, .vcf, .gff, .xls, .txt)
・解析レポート(.pdf, .html)
*CLC Genomics Workbench 2週間試用ライセンス付属
*解析データおよびレポートは、バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合に納品
最低注文数 1サンプル
納期(標準) 約2ヶ月(バイオインフォマティクス解析付: 約2.5ヶ月)
* 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルをお送りする場合は別途送料(海外)をご請求させて頂きます。

CLC Genomics Workbenchの2週間試用ライセンスを付属
CLC bio/QIAGEN社のCLC Genomics Workbenchは、あらゆるメーカーの次世代シークエンサーのデータ解析に対応し、アセンブルやマッピングなど、様々なアプリケーションデータ解析が可能な統合解析ソフトウェアです。
詳細
  

HiSeq2500

必要サンプル量

サンプル ・ゲノムDNA: 1μg以上(2μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 20ng/μL以上
・O.D.260/O.D.280: 1.8-2.0
・Buffer: TE bufferまたはddH2O
1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40min.
2. 必ずRNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブをご使用ください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE BufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃又は、-80℃で保存してください。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸なども同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

データ解析パイプライン



標準データ解析例


標準データ解析レポート(HTML形式のレポート)には、サンプル情報、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、アライメント、Variation detectionなどの結果がまとめられています。



税別価格


サービス名 目安
データ量(*1)
数量 税別単価 1) Cat.#
ヒト全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Human All Exon V6 58M
(raw data)
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoH6G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoH12G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
ヒト全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Human All Exon V6 58M
標準データ解析付き
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoH6GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoH12GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
マウス全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Mouse All Exon
(raw data)
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoM6G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoM12G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
マウス全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Mouse All Exon
標準データ解析付き
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoM6GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoM12GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Bovine全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Bovine All Exon
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoB6G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoB12G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Bovine全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Bovine All Exon
標準データ解析付き
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoB6GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoB12GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Canine全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Canine All Exon
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoC6G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoC12G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Canine全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Canine All Exon
標準データ解析付き
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoC6GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoC12GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Zebrafish全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Zebrafish All Exon
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoZ6G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoZ12G
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
Zebrafish全エクソーム受託解析サービス
-SureSelect Zebrafish All Exon
標準データ解析付き
6Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoZ6GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
12Gb 1-4サンプル お問合せ F-Novo-ExoZ12GD
-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
* ウシ、イヌ、ゼブラフィッシュをご希望の場合は、別途お問合せください。
* 10サンプル以上をご希望の場合は、別途お問合せください。
1) 海外へのサンプル輸送費用およびハードディスク費用が別途必要です。


【関連サービス】
クリニカルシークエンスデータ解析サービス
ヒトサンプルの遺伝子変異データに対して、各種データベースのアノテーションデータやサンプルの臨床情報を対応付けし、有意な変異の検出および遺伝医学者(MD)がサインしたクリニカルレポートの作成を行います。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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