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受託サービス
サービス別ラインナップ
次世代シークエンシング
- 概要
+ 受託解析サービスの流れ
+ QCシート

対応アプリケーション

+ シングルセル解析
シングルセルシークエンス
snRNA-Seq
+ 遺伝子パネル解析
全エクソームシークエンス
リキッドバイオプシー用
OptiSeq がんパネル解析サービス
+ トランスクリプトミクス解析
RNA-Seq
+ トランスラトミクス解析
Ribosome Profiling
+ エピゲノミクス解析
ChIP-Seq
ヒト全ゲノムメチル化
smallRNA-Seq
lncRNA-Seq
tRNA-Seq
tRF&tiRNA-Seq
(h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter
MeRIP-Seq
DRIPc-Seq
eccDNA-Seq
+ ゲノミクス解析
ヒト全ゲノムシークエンシング
ゲノムシークエンシング
PacBio ロングリード
ナノポアシークエンシング
+ メタゲノム解析
ショットガンメタゲノム
微生物ゲノムアンプリコン
+ Hi-Cシークエンス解析
Proximo Hi-C Genome Scaffolding
ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution
CytoTerra Cytogenomics
OncoTerra Oncology
+ 抗原特異的プロファイリング
HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析
MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析
+ Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析
Hybridoma Sequencing
Bulk B cell Sequencing
Display Library Sequencing
  
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次世代シークエンシング (NGS) 受託解析サービス

フィルジェンでは、今、最も注目を集める最先端テクノロジー、次世代シークエンシング(次世代シーケンシング/NGS)受託解析サービスをご提供しております。
信頼性の高い海外サービスプロバイダーと業務提供し、幅広い充実したサービスをご提供しています。
豊富なアプリケーションに対応できる様に、illumina NovaSeq6000, illumina HiSeq X Ten, illumina HiSeq 4000/2500、illumina MiSeq、NextSeq500、PacBio SequelⅡなど、複数の次世代シークエンサーをご用意しております。
ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(QIAGEN社/CLC bio)”も販売いたしております。
 














対応アプリケーション

■シングルセル解析
Novogene社
シングルセルシークエンス
受託解析サービス
10x Genomics Chromium システムと Illumina NGS プラットフォームを組み合わせることで、シングルセル遺伝子発現、シングルセル免疫プロファイリング、シングルセルATAC を含む、高品質なエンドツーエンドシングルセルソリューションとサービスを提供しています。

CD Genomics社
single-cell nuclear RNA sequencing(snRNA-seq)
受託解析サービス
単一細胞レベルで開発された技術であり、高分解能のシングルセルシークエンシング手法を用いて、凍結サンプルの核を直接捕捉し、細胞の不均一性を正確に区別するとともに、個々の細胞の遺伝子構造や遺伝子発現状態を明らかにすることができます。特にシングルセル実験では使用できない貴重な凍結細胞サンプルや不均一な細胞サンプルに関する課題を解決します。
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■遺伝子パネル解析
Novogene社
全エクソームシークエンス
受託解析サービス
エクソン領域をターゲットとしたエンリッチメントキットを使用し、その領域における多型や変異を検出することができます。

DiaCarta社
リキッドバイオプシー用
OptiSeq がんパネル
受託解析サービス
独自のテクノロジーを使用することで、ディープシークエンスなしにリキッドバイオプシーサンプル(cfDNA, ctDNA)からのがん変異遺伝子の検出が可能です。

■トランスクリプトミクス解析
Novogene社
RNA-Seq
受託解析サービス
cDNAライブラリーを作製し、転写産物のリードをタグとしてカウントすることで、ゲノムワイドな発現プロファイルの結果が得られます。新規エクソンや融合遺伝子の検出も可能。

 
EIRNA Bio社
Ribosome Profiling
受託解析サービス
リボソームに覆われた mRNA 断片の塩基配列を決定し、生体内で 1 塩基の分解能で翻訳のグローバルなスナップショットを提供するトランスラトーム解析です。また、翻訳中の mRNA に加え、通常の RNA-seq も解析するサービスです。
 

■エピゲノミクス解析
Novogene社
ChIP-Seq
受託解析サービス
クロマチン免疫沈降で得られたDNA断片をシークエンシングし、ゲノム配列上にマッピングし、ピーク領域の検出を行います。
ヒト全ゲノムメチル化
受託解析サービス
バイサルファイト処理したゲノムDNA全体を次世代シークエンシングすることで、網羅的かつ詳細にメチル化を解析します。
smallRNA-Seq
受託解析サービス
microRNAを含むsmallRNAの発現解析を行います。新規smallRNAの同定も可能です。
lncRNA-Seq
受託解析サービス
タンパク質をコードしない200nts以上の長さのRNAである、long non-coding(lnc)RNAの発現解析を行います。

Arraystar社
tRNA-Seq
受託解析サービス
tRNAの内部および末端修飾を効率的に除去し、高効率と高精度のRNA-seqを行います。tRNAのアノテーション、発現差解析など豊富なバイオインフォマティクス解析を含むサービスです。
tRF&tiRNA-Seq
受託解析サービス
多くの疾患に関連が見られる tRF&tiRNA のシークエンスおよびこれらの特化したバイオインフォマティクス解析を実施します。
(h)MeDIP-Seq
with LncRNA Promoter
受託解析サービス
mRNAに加えて、lncRNAの遺伝子プロモーターにおける(ヒドロキシ)メチル化解析が可能です。
MeRIP-Seq
受託解析サービス
抗N6-メチルアデノシン(m6A)抗体によるm6A免疫沈降~MeRIP-Seqデータ解析までのフルパッケージです。モチーフ解析、メチル化ピーク変動解析、GOおよびパスウェイ解析などが含まれます。
DRIPc-Seq
受託解析サービス
DRIPc-Seq(DNA-RNA 免疫沈降および cDNA 変換を組み合わせたハイスループットシークエンシング)では、ゲノムにおける LncRNA/mRNA の組織化された R-loop の分布をプロファイルします。本サービスのバイオインフォマティクス解析中の R-loop 分布をプロファイルします。
ecoDNA-Seq
受託解析サービス
eccDNA-Seq では、制限エンドヌクレアーゼ切断によって環状 mtDNA を線形化し、線形化された mtDNA と直鎖状染色体 DNA を直鎖 DNA 特異的エキソヌクレアーゼによって消化することで、サンプル中の eccDNA を無傷のまま濃縮します。ローリングサークル増幅(RCA)によって eccDNA を増幅し、eccDNA のシグナルとデータ品質を大幅に向上させます。micro-eccDNA と mega-eccDNA を同時にプロファイリング可能です。

■ゲノミクス解析
Novogene社
ヒト全ゲノムシークエンシング 受託解析サービス HiSeq X Tenを用いて、ヒト全ゲノムシークエンシング解析を行うサービスです。
ゲノムシークエンシング
受託解析サービス
新規ゲノムのドラフト解析/ゲノムリーシークエンシング解析を行うサービスです。
PacBio RSⅡロングリード
受託解析サービス
PacBio SequelⅡを用いた平均4000bpのリングリード解析です。
新規ゲノムやコンティグ整列などに利用可能。
ナノポアシークエンシング
受託解析サービス
PromethION(Oxford Nanopore)を採用したロングリード解析です。群集規模のシークエンスや植物ゲノミクスの様な大規模プロジェクトに最適です。


■メタゲノム解析
Novogene社
ショットガンメタゲノム
受託解析サービス
NovaSeq6000を用いて解析します。
環境中微生物のゲノムDNAをすべて抽出・収集し、これらの全ゲノムを網羅的にシークエンスします。得られた配列データをリファレンス配列と相同性検索をすることで、菌種の帰属や菌種組成、挿入、欠失などの情報が得られます。また、機能遺伝子のデータベースに対して相同性検索を行うことで、その細菌嚢がどの様な機能遺伝子をもっているかの情報を得ることもできます。
微生物ゲノムアンプリコン
受託解析サービス
細菌の16S、真菌の18SおよびITS(internal transcribed spacer)を指標とした解析を行います。複数設計されたプライマーセットよりご希望のプライマーセットを選択して頂けます。また、ご自身で設計したプライマーセットでの解析にも対応しています。

Hi-Cシークエンス解析
Phase Genomics社
ProximoTM Hi-Cゲノム
スキャフォールディング
受託解析サービス
新たな方法を用いたスキャフォールディングアプローチによって、DNAの近接度(プロキシミティ)を in vivo で測定し、その情報を利用してコンティグから染色体スケールのスキャフォールドを行います。
ProxiMetaTM Hi-Cメタゲノム
デコンボリューション
受託解析サービス
in vivo Chromosome Conformation Capture によるDNAの近接情報の物理的補足に基づいて、自然な条件下にある混合サンプルの全ゲノムアセンブリを可能にします。同じ種・株に由来するシークエンスの分類を可能にし、数十、数百の稀少で培養可能な新規微生物のゲノムを取得します。
CytoTerraTM Cytogenomics
受託解析サービス
CytoTerra Cytogenomics Platform は、従来の細胞遺伝学のゲノムワイドな構造変異検出力と、染色体マイクロアレイおよびFISHの分子レベルの制度を、コスト効率の高い単一のNGSベースのアッセイに統合したプラットフォームです。
OncoTerraTM Oncology
受託解析サービス
高解像度ゲノム技術を活用して、精密腫瘍学の可能性を広げます。超長距離シークエンシングの独自の強みを活かし、FFPEサンプルに含まれる豊富な診断および予後情報を、コスト効率に優れたスケーラブルなNGSベースのアッセイで実現しました。

抗原特異的プロファイリング
CDI Laboratories社
HuScanTM PhIP-Seq Antibody Profiling
受託解析サービス
T7 バクテリオファージ免疫沈降シークエンス(PhIP-Seq)は、ハイスループット DNA シークエンスと次世代プロテオミクスを組み合わせて、抗原特異的抗体の個人固有のフィンガープリントを決定する多重化分析の方法です。
全ヒトプロテオーム全体に対し、エピトープレベルの抗体プロファイリングを提供します。
MouseScanTM PhIP-Seq Antibody Profiling
受託解析サービス
T7 バクテリオファージ免疫沈降シークエンス(PhIP-Seq)は、ハイスループット DNA シークエンスと次世代プロテオミクスを組み合わせて、抗原特異的抗体の個人固有のフィンガープリントを決定する多重化分析の方法です。
全マウスプロテオーム全体に対し、エピトープレベルの抗体プロファイリングを提供します。

■ReptorTM 免疫レパートリーシークエンス解析
Abterra bio社
Hybridoma Sequencing Service ハイブリドーマ細胞株が産生する抗体の可変重領域(VH)と可変軽領域(VL)をコードする cDNA の配列情報を取得する解析サービスです。アイソタイプを決定するために、全長可変領域および定常領域の約9ヌクレオチドを配列決定します。
Buk B cell Sequencing Service B細胞の表面に存在する膜型免疫グロブリンであるB細胞受容体(BCR)の配列情報を取得します。
バルクB細胞(組織、細胞、血液、ファージミド)をご提供頂き、BCRレパートリー分析を行います。時系列/空間/ケースごとにデータを取得することで、その多様性を把握、比較することができます。
Display Library Sequencing ファージライブラリーをNGS分析することで、ライブラリーの多様性をハイスループットで評価できるサービスです。
ファージディスプレイ技術は、標的特異的ペプチド/タンパク質をスクリーニング及び単離するための強力な技術です。
バクテリオファージに遺伝子を挿入し、外来ペプチドまたは抗体をその表面に発現させたファージライブラリーと、標的分子を反応させ、選択操作(バイオパニング)を行うことにより、標的分子に結合するファージ群を濃縮することができます。
バイオパニングプロセスを通じて一部のクローンが支配的になり、最終的なスクリーニング後に利用可能なクローンの数が限られるということが、ファージディスプレイ技術の欠点の一つとして挙げられますが、本サービスでは、バイオパニングの各ラウンド後に得られた濃縮ファージライブラリーについてNGS分析を行うことで、どのクローンが陽性である可能性が高いかについての洞察を提供することができます。

■次世代シークエンスデータマイニングサービス

弊社では、CLC bio社の認定データ解析サービスプロバイダーとして、次世代シークエンスのデータ解析サービスをご提供しています。SNP/挿入・欠失解析、Exome解析、RNA-Seq解析、microRNA解析、ChIP-Seq解析、アセンブルなど、各種アプリケーションに対応した解析から、遺伝子予測やBLAST解析などの各種解析を行っています。

 ⇒詳細情報
Authorized
Service Provider


次世代シークエンサーとは?

従来のサンガー法とは異なり、次世代シークエンサーは、1回のランで数千万~数十億bpの塩基配列情報を得ることができ、ヒトの全ゲノム配列解読も可能な高性能かつハイスループットな技術です。コストパフォーマンスにも優れ、短いゲノム配列を大量に読むことによって、より信頼度の高いデータを得ることができます。新規ゲノム配列決定やSNP検索以外にも、ゲノム染色体異常(欠失や転座)、遺伝子発現解析、smallRNA解析やChIP-Seqなど、様々なアプリケーションへの応用が可能です。


業務提携先について

■Novogene社
Novogene社(中国)は、BGIに所属していた研究者がスピンアウトして設立した会社で、次世代シークエンス解析及び、バイオインフォマティクスにおける最高水準の研究開発とサービスを提供している企業です。illumina NovoSeq6000も保有しており、ヒト全ゲノムシークエンシング解析(WGS)をこれまでにないコストパフォーマンスと処理能力で提供しています。

■Phase Genomics社
Phase Genomics社(アメリカ)は、高次のDNA構造を利用して、動植物ゲノムのスキャホールドおよびメタゲノムのアセンブリを劇的に向上させる、ProximoTM Hi-Cスキャフォールディング解析、ProxiMetaTM Hi-Cメタゲノムデコンボリューション解析を提供しています。

■DiaCarta社
DiaCarta社(アメリカ)は、独自の核酸分子クランプを採用したテクノロジーによって、変異遺伝子を高感度かつ高精度に増幅させることで、がんの変異遺伝子の検出ができる、ターゲットシークエンスサービス、および変異検出キットを販売しています。


受託解析サービスの流れ

詳細情報
DiaCarta社 詳細情報


カタログダウンロード

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 QIAGEN社(CLC bio) 次世代シークエンスデータ解析ソフトウェア


 
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