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*ヒト全ゲノムシークエンス 2017 ウィンターキャンペーン実施中!
 期間:2017/1/末まで  ⇒キャンペーンちらし(PDF)

次世代シークエンシング(次世代シーケンシング)サービス
ヒト全ゲノムシークエンス 受託解析サービス
フィルジェンでは、Novogene社との業務提供し、次世代シークエンスサービス/ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービスをご提供しています。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。

概要


遺伝的変異は、ほとんどすべてのヒト疾患に影響を与えます。生殖細胞変異は、希少疾患や一般的な疾患における遺伝的要因あるいは一因となり、さらに体細胞変異は癌の発症や進行における要因となります。全ゲノムシークエンシング(WGS)を利用することで、個人の遺伝子構成をカタログ化し、単一アッセイにて存在する全ての変異を検出することができます。また、ゲノムワイドな遺伝的変異、病原性そして感受性遺伝子の検出、さらに遺伝子多様性解析と遺伝進化解析を可能にします。本サービスでは、集団規模のヒト全ゲノムシークエンスを念頭にデザインされた最強のシークエンスプラットフォームHiSeq X Tenシステムを使用することで、今までにないコストパフォーマンスと処理能力を提供します。



ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービスのワークフロー


サービスの仕様


使用機種 illumina HiSeq X Ten
ライブラリー種類 PE150
保証データ量 90Gb raw data
作業内容 サンプルQCチェック, ライブラリー作製, シークエンス作業、バイオインフォマティクス解析(オプション)
納品データ(標準) HDD/USB(NTFSフォーマット)にて以下のデータを納品
・シークエンスデータ(.fastq)
・解析データ(.bam, .vcf, .gff, .xls, .txt)
・解析レポート(.html)
*CLC Genomics Workbench 2週間試用ライセンス付属
*解析データおよびレポートは、バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合に納品
最低注文数 1サンプル
納期(標準) 約2ヶ月(バイオインフォマティクス解析付: 約2.5ヶ月)

CLC Genomics Workbenchの2週間試用ライセンスを付属
CLC bio/QIAGEN社のCLC Genomics Workbenchは、あらゆるメーカーの次世代シークエンサーのデータ解析に対応し、アセンブルやマッピングなど、様々なアプリケーションデータ解析が可能な統合解析ソフトウェアです。
詳細
  

必要サンプル量

サンプル ・ゲノムDNA:1μg以上(2μg以上を強く推奨)
・容量: 20μg以上
・濃度: 20ng/μL以上
・O.D.260/O.D.280:1.8-2.0
・Buffer: TE bufferまたはddH
2O
(注意事項)
1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min.
2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE BufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃又は、-80℃で保存してください。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

納品データ例
充実した解析レポートを標準で添付して納品いたします。
スタンダードデータ解析レポートには、サンプル情報、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、アライメント、Varidation detectionなどの結果がまとめられています。



Sample information

Library construction workflow

Raw data filtration result

Sequencing error rate distribution

GC content distribution

Sequencing quality distribution

Sequencing depth, coverage distribution

The coverage depth and coverage rate of chromosome

The number of Somatic SNP in different genome region

The number of different type INDEL

Somatic mutation rate figure

Mutation features, frequency histogram of different type of mutation

Mutation features, frequency spectrum of different type of mutation
-


価格

サービス内容 データ量 数量 税別単価 *1 Cat.#
ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービス
(Raw data)
90Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-WGS90
ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービス
標準データ解析付
90Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-WGS90D
* 90Gb以上をご希望の場合は、別途お問合せください。
*1  海外へのサンプル輸送費用および納品用ハードディスク費用が別途必要です。


【関連サービス】
クリニカルシークエンスデータ解析サービス
ヒトサンプルの遺伝子変異データに対して、各種データベースのアノテーションデータやサンプルの臨床情報を対応付けし、有意な変異の検出および遺伝医学者(MD)がサインしたクリニカルレポートの作成を行います。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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