製品・サービス情報
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Arraystar社製品
RNA 解析用 PCR アレイパネル |
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 製品概要
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本製品は、リアルタイムPCRアレイのパネル製品です。この製品は、tRNA、tRF、tiRNA、microRNA、snoRNA など、ほぼ全ての
small ncRNA をカバーしています。ノンコーディング RNA クラスの発現プロファイリングに特化した「nrSTARTM シリーズ」と新しい研究分野のタンパク質因子や酵素のmRNA発現プロファイルに特化した「NuRNATM シリーズ」の2つのシリーズがあります。
◆製品ラインナップ及び価格
品番、価格、マニュアルを下記ファイルからご確認いただけます。
⇒製品ラインナップ一覧  |
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nrSTARTM シリーズ
チラシ（PDF） |
NuRNATM シリーズ
チラシ（PDF） |
◆特長
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・各RNA・遺伝子の網羅的な定量プロファイリングに使用可能です。
・1,000を超える引用文献によって、Arraystar社製品の品質は証明されています。 |
◆ワークフロー
◆対応機種（※384well プレートに対応したリアルタイムPCR機器が必要です。）
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・ABI ViiATM 7、7500、7500 FAST、7900HT
・ABI QuantStudioTM 5、6 Flex、7 Flex、12K Flex
・Bio-Rad CFX384、iCycler、iQ
・Eppendorf Realplex
・Roche Light Cycler 480（※品番末尾「-R」の製品のみ） |
◆解析ツールについて
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この解析ツールには、プライマーリスト、アノテーション情報、qPCR用の各種計算ツールが含まれます。
使用する際には、比較サンプルが 4 以上必要ですのでご注意ください。
（ツールを機能させるために、2 キット以上のご購入が必要な場合があります。）
解析ツールの使用方法については、各解析ツールファイルの最初のタブをご確認ください。 |
◆製品ラインアップ
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 LncRNA 解析用パネル
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【nrStarTM Functional LncRNA PCR Array】
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LncRNA（ロングノンコーディングRNA）は、200nt 以上の非タンパク質コードRNAの一つです。胚発生、多機能性幹細胞、細胞機能の特定、ゲノムインプリンティング、心臓の発生、造血、免疫、内分泌系などの生物学的機能に関わっています。LncRNA
の発現調節異常は、がん、神経変性疾患、心血管疾患、腎臓疾患、糖尿病などに影響します。本製品による LncRNA 発現のプロファイリングは、これらの疾患における
LncRNA の機能と分子機構の調査に役立ちます。
| ≫ |
既知の生物学的機能または疾患関連性を持つ 372 ヒト/185 マウス LncRNA をプロファイリング |
| ≫ |
包括的なアノテーションが可能 |
| ≫ |
様々なサンプルタイプで検証されたプライマーセット |
| ≫ |
転写物特異的な PCR プライマーによって個々の LncRNA アイソフォームを明確かつ正確に検出 |
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LncRNA PCR アレイ（PDF） |
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| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| nrStarTM Human Functional LncRNA PCR Array |
384well/plate |
AS-NR-004-1 |
PDF |
Excel |
| nrStarTM Mouse Functional LncRNA PCR Array |
384well(2*192)/plate |
AS-NR-004M-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
※引用文献（一部）
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 tRNA 関連解析用パネル
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【tRNA PCR アレイ】
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| ≫ |
GtRNAdb に掲載されたすべてのアンチコドンアイソアクセプターのプロファイリング |
| ≫ |
tRNA スコア＞50 の信頼性の高い tRNA を対象（ヒト tRNA PCR アレイ） |
| ≫ |
多数の細胞株と組織で検証されたプライマー |
185 のヒト/マウス tRNA をプロファイルし、GtRNAdb にカタログされているすべての核アンチコドンアイソアクセプター（isoacceptor）をカバーし、アイソアクセプターと特定のアイソデコーダー（isodecorder）発現を検証することができます。生体内に豊富に存在する
tRNA は、タンパク質翻訳の要となっています。同じアミノ酸を持つ tRNA を「アイソアクセプター、アンチコドンは同じだが配列が異なるものを「アイソデコーダー」と呼び、生物の機能や疾患に重大な影響を与える非翻訳制御機能を持つ可能性が示されています。さらに、豊富に存在する
tRNA は、バイオマーカーとしても研究されています。 |
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（クリックして拡大）
図：tRNA の役割と機能
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（メーカーサイト）
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| nrStarTM Human tRNA PCR Array V2.0 |
384well(2*192)/plate |
AS-NR-001H-1 |
PDF |
Excel |
| nrStarTM Mouse tRNA PCR Array |
384well(2*192)/plate |
AS-NR-001M-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
※引用文献（一部）
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【tRNA 修飾酵素 PCR アレイ】
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| ≫ |
UniProt および Modomics に掲載されたすべての tRNA 修飾酵素カバー |
| ≫ |
最適化されて厳密に検証されたプライマーペアとアッセイ |
| ≫ |
サンプルの前増幅が不要 |
tRNA 修飾に関与する 85 の重要な酵素およびタンパク質因子の遺伝子発現をプロファイリングします。tRNA は、転写後に多数の化学修飾を受けて高度に修飾されます。修飾は、フォールディング、安定性、解読など、tRNA
機能の形成・微調整・制御するために不可欠です。例えば、ステムループの修飾は tRNA の構造と安定性に、アンチコドンループの修飾は翻訳精度に、34
位の修飾はコドンとアンチコドンのゆらぎに、アンチコドンループに隣接する修飾はコドンとアンチコドンの相互作用を微調整するために重要です。これらの化学修飾は、tRNA
修飾酵素によってダイナミックに制御・触媒されます。Arraystar 社は、tRNA 修飾に関与する酵素を迅速にプロファイリングできる様に、パネル式のPCRアレイキットを初めて作製しました。 |
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（クリックして拡大）
図：ヒト tRNA 修飾と tRNA 修飾酵素（括弧内） |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| NuRNATM tRNA Modification Enzymes PCR Array |
384well(4*96)/plate |
AS-NM-001-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
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 tRF&tiRNA PCR アレイ
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【tRF&tiRNA PCR アレイ】
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| ≫ |
最新の出版物で報告された 185 のヒト tRF&tiRNA と、tRFdb データベースから選択された 88 のマウス tRF をプロファイリング |
| ≫ |
5' および 3' アダプターを利用することによって、特定の tRF&tiRNA の増幅が可能 |
tRF&tiRNA は、microRNA として標的 mRNA の安定性を調節しています。tRF&tiRNA の組成と発現量は、細胞の種類に大きく依存しており、多くの疾患に関連しています。tRF&tiRNA は、tRNA または pre-tRNA から生成され、同じ配列を持つため従来の qPCR ではそれらを区別することが困難でした。さらに、
tRF&tiRNA の長さは 16~50nt であり、qPCR を実行するには短すぎることも課題の一つでした。そこで、Arraystar 社は、tRF&tiRNA の 3'末端と 5'末端に 2 つのアダプターを導入する方法を開発しました。本製品は、tRF&tiRNA をその前駆体やその他の低分子
RNA から効率的に識別し、信頼性が高く正確な tRF&tiRNA 発現解析を実現します。 |
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（クリックして拡大）
図：5' および 3' アダプターを導入することにより
特定の tRF&tiRNA を検出可能 |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| nrStarTM Human tRF&tiRNA PCR Array |
384well(2*192)/plate |
AS-NR-002-1 |
PDF |
Excel |
| nrStarTM Mouse tRF PCR Array |
384well(4*96)/plate |
AS-NR-002M-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
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※引用文献（一部）
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SnoRNA 解析用パネル
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【snoRNA PCR アレイ】
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| ≫ |
PCR で識別可能な全ての snoRNA、snoRNA ターゲット、および snoRNP メンバーをカバー |
| ≫ |
必要な totalRNA はわずか 50ng。前増幅は不要。 |
| ≫ |
全ての snoRNA は、細胞・組織・血漿・血清サンプルを用いて検証済み |
低分子核小体 RNA(snoRNA;
small noncoding RNA) は、60-300nt の中程度の長さの低分子非コード RNA で、核小体低分子 RNA-蛋白質複合体 (snoRNP;small
nucleolar ribonucleoprotein) の重要な構成要素です。snoRNA は、rRNA のプロセシングとスプライシング、翻訳、酸化ストレスの制御に関与しています。
snoRNA は、各疾患における生体サンプルでも安定して発現しており、診断や治療の標的として、また有望なバイオマーカーとして、活発な研究対象となっています。特に、がんにおける
snoRNA の発現調節異常と転移に関する研究は、盛んに議論されています。 |
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（クリックして拡大）
図：snoRNA の構造と機能 |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| nrStarTM Human snoRNA PCR Array |
384well/plate |
AS-NR-003-1 |
PDF |
Excel |
| nrStarTM Mouse snoRNA PCR Array |
384well/plate |
AS-NR-003M-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
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※引用文献（一部）
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microRNA 関連 解析用パネル
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【Canonical microRNA PCR アレイ】
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| ≫ |
スターフォームを持つ miRNA ではなく、高発現で機能的な標準的に保存された 372 の成熟 miRNA にフォーカス |
| ≫ |
Two-tailed qPCR テクノロジーにより、miRNA をその前駆体、isomiR、およびファミリーメンバーから高特異的に識別 |
| ≫ |
miRNA 遺伝子プロモーター、primary miRNA、宿主遺伝子に関する包括的なアノテーション |
| ≫ |
強力な前増幅によって low input サンプルを定量化 |
図：本アレイキットの miRNA 収集パイプライン |
1917 のヒト miRBase エントリーのうち、確実にサポートされている成熟 miRNA は 1/3 程度です。本製品では、372 のカノニカルに保存された成熟
miRNA に焦点を当てることによって、シンプルで正確なソリューションを提供します。miRNA は小さい上に、ファミリーメンバーと isomiR
間の相同性が高く、さらには存在量が少ないため、miRNA 発現プロファイリングは技術的に困難なことが多いです。そこで Arraystar 社は、miRNA
の両端を伸長して 5' 領域と 3' 領域の両方の miRNA を高度に特異的に調べることにより、総 RNA が 100pg 未満であっても、miRNA
をその前駆体、他のすべてのファミリーメンバーおよび isomiR から効率的に分離することができる、強力な two-tailed qPCR テクノロジーを開発しました。
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| nrStarTM Human Canonical Conserved miRNA PCR Array |
384well/plate |
AS-NR-005H-1 |
PDF |
Excel |
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Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-003）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。Low input サンプル（100pg～200ng の total RNA）の場合、cDNA
合成と前増幅には cDNA 合成キット（品番AS-FS-006）が必要です。 |
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Small RNA 合成タンパク質 解析用パネル
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【small RNA 生合成タンパク質 PCR アレイ】
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| ≫ |
Small RNA 生合成経路の酵素・タンパク質因子をコードする 185 の mRNA 発現をプロファイリング |
| ≫ |
small RNA バイオタイプの生合成経路を同時に解析 |
| ≫ |
硬度に最適化されて設計されたプライマーペア |
Small RNA は、長さ 200nt 未満の非コード RNA であり、その分子特性と生物学的機能に基づいて、7 つのバイオタイプ(piRNA、siRNA、snoRNA、snRNA、tRNA、tRNA
関連フラグメント (tRF))に分類されています。低分子 RNA 生合成経路は、これらの低分子 RNA を生成する基礎的なプロセスであり、細胞の状態に応じて制御され、各疾患に関連していることも多くあります。本製品では、small
RNA 生合成遺伝子オントロジー(GO)経路に分類される 185 の mRNA 遺伝子の発現をプロファイリングします。 |
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（クリックして拡大）
図：small RNA バイオタイプの生合成と機能 |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| NuRNATM Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array |
384well(2*192)/plate |
AS-NM-002-1 |
PDF |
お問合せ |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
| * |
ターゲット一覧⇒PDF |
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mRNA 関連 解析用パネル
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【中枢代謝酵素 PCR アレイ】
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| ≫ |
重要な代謝経路および代謝産物輸送システムの酵素・タンパク質成分を系統的にカバー |
| ≫ |
Uniorot データベースの標準タンパク質/サブユニット配列をコードする mRNA 転写物を検出 |
疾患における異常な代謝経路を包括的に理解することは、臨床バイオマーカーや潜在的な治療標的を見つけるのに役立ちます。本製品は、グルコーストランスポーター、解糖系、糖新生、脂肪酸酸化、ヌクレオチド代謝、その他多数の代謝経路に関与する中枢代謝経路および重要な代謝産物輸送システムにおける酵素およびタンパク質の 373 転写産物をプロファイリングします。
メーカーサイト： がん代謝の概要 |
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（クリックして拡大）
図：がん代謝の概略 |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| NuRNATM Human Central Metabolism PCR Array |
384well/plate |
AS-NM-004-1 |
PDF |
Excel |
| * |
Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
| * |
cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
※引用文献（一部）
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【エピトランスクリプトミクス PCR アレイ】
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エピトランスクリプトミクス：ゲノミクス、エピゲノミクス、トランスクリプトームを超えた刺激的な遺伝子制御の新しい分野 |
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Uniorot の標準タンパク質/サブユニット配列をコードする代表的な miRNA 転写物を検出 |
RNA 修飾を介した遺伝子制御における近年の大きな進歩により、ゲノミクス、エピゲノミクス、トランスクリプトームを超えたエピトランスクリプトオミクスという新しい分野が誕生しました。
N6-メチルアデノシン（m6A）、5-メチルシチジン（m5C）、イノシン（I）、プソイドウリジン（Q）、N1-メチルアデノシン（m1A）、5-ヒドロキシルメチルシチジン（hm5C）などの修飾は、m
RNA の機能や代謝調節に影響しています。RNA 修飾には、修飾を導入する修飾酵素（writer）、書き込まれた修飾を消去する酵素（eraser）、RNA 修飾を認識するタンパク質（reader）などがあり、ダイナミクスな遺伝子制御が深く関わっています。本製品は、これらの
writer、eraser、reader を網羅的にプロファイリングするリアルタイム
PCR 用アレイパネルです。 |
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（クリックして拡大）
図：mRNA 修飾とその機能 |
| 品名 |
サイズ |
品番 |
マニュアル |
解析ツール |
| NuRNATM Human Epitranscriptomics PCR Array |
384well(4*96)/plate |
AS-NM-003-1 |
PDF |
Excel |
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Roche Light Cycle 480 で使用される場合は、パネル品番末尾に「-R」を追加してください。 |
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cDNA 合成キット（品番：AS-FS-001）およびマスターミックス（品番：AS-MR-005/006)と併せてご使用ください。 |
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