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Arraystar
【RNA解析用PCRアレイパネル】
 - LncRNA 解析用パネル
 - tRNA 関連解析用パネル
 - tRF&tiRNA 解析用パネル
 - SnoRNA解析用パネル
 - microRNA 解析用パネル
 - small RNA 合成タンパク質解析用パネル
 - mRNA 関連解析用パネル
【リアルタイムPCR用試薬】
 - マスターミックス
 - cDNA合成キット
 - tRNA検出用プライマー
 - マスターミックス
 - cDNA合成キット
【NGSライブラリー調製試薬】
 - rRNA 除去キット
 - ポリ(A)mRNA 分離キット
  
ソフトウェア
製品別ラインナップ
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Arraystar社製品
リアルタイムPCR用試薬
【RNA解析用
 PCRアレイパネル】
LncRNA 解析用パネル/tRNA 関連解析用パネル/tRF&tiRNA 解析用パネル/SnoRNA解析用パネル/microRNA 解析用パネル/small RNA 合成タンパク質解析用パネル/mRNA 関連解析用パネル
【リアルタイムPCR用試薬】 マスターミックス/cDNA合成キット/tRF & tiRNA 前処理キット/プライマーセット/RNA 精製用磁気ビーズ
【NGSライブラリー調製試薬】 rRNA 除去キット/ポリ(A)mRNA 分離キット


マスターミックス

ArrayStar のSYBR® Green qPCR Master Mix には、TaqDNA ポリメラーゼ、SYBR® Green I 色素、MgCl2、dNTP および安定剤が含まれています。リアルタイム定量PCRアッセイに最適化されており、高い安定性、特異性を備えています。Applied Biosystems のすべてのリアルタイムPCR機器、Bio-Rad iQTM 5 および CFXTM(96 または 383)、Roche LightCyclerTM 480 システムに対応しています。

【ワークフロー】

【製品ラインアップ】
製品名 ROX リファレンス色素 サイズ 品番 マニュアル
Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-) なし 5ml AS-MR-005-5 PDF
25ml AS-MR-005-25
Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+) あり 5ml AS-MR-006-5
25ml AS-MR-006-25


cDNA合成キット


cDNA合成用のキットである rtStarTM cDNA Synthesis Kit には、逆転写反応に必要な試薬が含まれており、cDNA 合成の効率と精度が最も高くなる様設計されています。このキットに含まれる RNA スパイクインは、cDNA 合成効率のモニタリングや qPCR データ比較のリファレンスとして使用することができます。複数のラインアップがあり、total RNA、tRNA、miRNA およびその他の small RNA の逆転写にそれぞれ適しています。
※Arraystar社の RNA 解析用 PCR アレイパネルと併用の場合、製品ラインナップ一覧(Excel)にて、パネルに合った製品をご選択ください。

【ワークフロー】


【製品ラインアップ】

【PolyA mRNA、lncRNA、snoRNA、totalRNA PCR アレイ用 cDNA 合成キット】

qPCR 用に Oligo(dT)またはランダムプライマーを用いた逆転写反応により total RNA から cDNA を合成します。RNaseH 活性を必要とせず、高温化で強い二次構造を持つターゲットの効率的な逆転写を行うことにより、特異性を増加させて cDNA の収量を向上させます。RNA スパイクインは、cDNA 合成のモニタリング効率や qPCR データ比較のリファレンスとして使用することができます。


【tRNA PCR アレイ用 前処理&cDNA 合成キット】

ランダムプライマーを用いた逆転写反応により、tRNA から qPCR 用の cDNA を合成します。tRNA に豊富に含まれる内部修飾(m1A, m3C, m1G)を効率的に除去して、cDNA 合成中の逆転写酵素の進行を確実にします。また、未処理サンプルと比較して、処理済みサンプルでは、tRNA の検出感度と定量精度を大幅に向上させます。
※引用文献(一部)
tRNA Ini CAT inhibits proliferation and promotes apoptosis of laryngeal squamous cell carcinoma cell. Shen Z, et al. Journal of Clinical Laboratory Analysis, 2021
Gene-Specific Control of tRNA Expression by RNA Polymerase II. Gerber A, et al. Molecular Cell, 2020
Quantitative tRNA-sequencing uncovers metazoan tissue-specific tRNA regulation. Pinkard O,et al. Nature Communications, 2020


【tRF&tiRNA、miRNA PCR アレイ用 cDNA 合成キット】

small RNA から qPCR 用の cDNA ライブラリーを合成します。3'アダプターの 5'末端を RNA の 3'末端に、5'アダプターの 3'末端を RNA の 5'末端にライゲートします。3'アダプターと 5'アダプターの非ライゲーション末端は修飾によってブロックされています。3'アダプターには、逆転写プライマーのユニバーサルプライミングサイトが含まれています。
※引用文献(一部)
tRNA-Derived Fragment tRF-5009A Regulates Autophagy and Degeneration of Cartilage in Osteoarthritis via Targeting mTOR. Deng Z,et al. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 2022
tRNA-derived fragment tRF-1020 ameliorates diabetes-induced retinal microvascular complications. Ma C,et al. Journal of Cellular and Molecular Medicine, 2022
METTL1-m7G-EGFR/EFEMP1 axis promotes the bladder cancer development. Ying X, et al. Clinical and Translational Medicine, 2021

【low input miRNAs、tRF&tiRNA PCRアレイ用 cDNA 合成キット】

前増幅が必要な low input RNA から cDNA ライブラリーを作成します。5' および 3'アダプター領域のプライミング部位から、PreAMP PCR Super Mix によって前増幅を行います。このキットには、優れた処理能力を持つ熱安定性の DNA ポリメラーゼが含まれています。

品名 対象RNA 容量 品番 マニュアル
rtStarTM First-Strand cDNA Synthesis Kit PolyA(/-)mRNAs,
lncRNAs, snoRNA
12反応分 AS-FS-001 PDF
rtStarTM tRNA Pretreatment & First-Strand
cDNA Synthesis Kit
tRNA 12反応分 AS-FS-004 PDF
rtStarTM First-Strand cDNA Synthesis Kit
(3' and 5' adaptors)
tRF&tiRNA, miRNA 6反応分 AS-FS-003 PDF
12反応分 AS-FS-003-2 PDF
rStarTM PreAMP cDNA Synthesis
for Small RNA
low-input miRNAs,
tRF&tiRNA
6反応分 AS-FS-006 PDF
12反応分 AS-FS-006-2 PDF


tRF & tiRNA 前処理キット


前増幅が必要な low input RNA から cDNA ライブラリーを作成します。5' および 3'アダプター領域のプライミング部位から、PreAMP PCR Super Mix によって前増幅を行います。このキットには、優れた処理能力を持つ熱安定性の DNA ポリメラーゼが含まれています。
品名 サイズ 品番 マニュアル
rtStarTM tRF&tiRNA Pretreatment Kit 12反応分 AS-FS-005 PDF


※引用文献(一部)
tRNA-Derived Fragment tRF-5009A Regulates Autophagy and Degeneration of Cartilage in Osteoarthritis via Targeting mTOR. Deng Z,et al. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 2022
tRNA-derived fragment tRF-1020 ameliorates diabetes-induced retinal microvascular complications. Ma C,et al. Journal of Cellular and Molecular Medicine, 2022
Genome-Wide Repertoire of Transfer RNA-Derived Fragments in a Mouse Model of Age-Related Cataract. Zhang G,et al. Current Eye Research, 2022


プライマーセット


ArrayStar 社のPCRアレイに使用されているプライマーは、個別で購入することができます。ご使用の際は、同メーカーの cDNA 合成キット(品番:AS-FS-00*)およびマスターミックス(品番:AS-MR-005/006)が必要です。サイズは、すべて200反応分です。

≫検証済みのプライマーによる信頼性の高い結果
≫高い感度と特異性
≫広い直線範囲にわたる正確な定量が可能
≫検証済みプライマーと SYBR® Green アッセイによる時間とコストの節約

品名 対象RNA 生物種 品番 プライマーリスト マニュアル
rtStarTM Pre-designed tRNA Primer Set *1 tRNA ヒト用 AS-NR-001-1-M PDF PDF
マウス用 AS-NR-002-1-M PDF
rtStarTM Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Set *2 tRF&tiRNA ヒト用 AS-NR-002-1-M PDF
rtStarTM Pre-designed Mouse tRF Primer Set *2 マウス用 AS-NR-002M-1-M PDF
rtStarTM Pre-designed Functional LncRNA Primer Set *3 LncRNA ヒト用 AS-NR-004-1-M PDF
マウス用 AS-NR-004M-1-M PDF
*1 同社の cDNA 合成キット(品番:AS-FS-004)と併せてご使用ください。
*2 同社の cDNA 合成キット(品番:AS-FS-003)と併せてご使用ください。
*3 同社の cDNA 合成キット(品番:AS-FS-001)と併せてご使用ください。


RNA 精製用磁気ビーズ


酵素処理(DNase I など)後の RNA 精製のために開発された磁気ビーズ
17nt の短い RNA を効率的に回収可能
大きな RNA(>5S rRNA、>120nt)および小さな RNA(<5S rRNA)の選択的濃縮
低分子 RNA 画分濃縮によるサイズカットオフ(<5S、<120nt)により、効果的にサイズ排除を実行可能
シングルチューブおよび自動ハイスループット 96/384well plate フォーマットの両方に対応
qPCR、マイクロアレイ標識、NGSライブラリー調製のサンプル調製に使用可能

右図:7.5% 尿素-PAGE での検証結果
Total RNA(>17nt)、LARGE RNA(>5S rRNA サイズ)または SMALL RNA(<5S rRNA サイズ)は、本製品によって効果的に分離・精製されました。
品名 サイズ 品番 マニュアル
Seq-StarTM RNAClean and smallEnrich Beads 10mL AS-MB-009 PDF

お問い合わせ 試薬機器部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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