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GROMACS Wizard
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GROMACS Wizard では、分子動力学シュミレーションツール GROMACS を SAMSON connect に実装し、力場等の選択、エネルギー最小化、NVT・NPT
平衡化・実際のシュミレーションまで一連のプロセスを GUI 上で実行することができます。また、計算リソースが要求される平衡化やシュミレーションのプロセスに関しては、別途コンピューティングクレジットをご購入いただくことで、クラウド環境を利用して計算を行うこともできます。
≫解析例はこちら |
Conformer Creator
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Universal Force Field（UFF）を用いたエネルギー計算により、安定なコンフォーマーの探索が可能です。 |
Pepsi-SAXS
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選択した分子からの小角X線散乱パターンをGUI上で計算できます。
Pepsi-SAXSは、従来のアルゴリズムである Crysol, FoXs や 3D-Zernike と同様に正確な計算が可能ですが、大幅に計算速度が向上しています。 |
Graphene Image Analyzer
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Graphene Image Analyzer では、グラフェンの TEM 画像を読み込むことで、グラフェンのモデルを生成することが可能です。生成したモデルから論文発表用の図を作成したり、各種シュミレーションを行うことが可能です。 |
TMD Image Analyzer
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TMD Image Analyzer では、遷移金属ジカルコゲナイド（TMD）のTEM画像を読み込むことで、TMDのモデルを生成することが可能です。生成したモデルから論文発表用の図を作成したり、各種シュミレーションを行うことが可能です。遷移金属は、モリブデン、タングステン、カルコゲンは、硫黄、セレンに対応しています。 |
SMILES Manager
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数千の分子の SMILES 記法を読み込み、目的の分子をフィルタリングによって抽出することができます。抽出した分子を 2 次元の構造データとして出力したり、3D
モデルとして GUI 上に表示することができます。
また、ソフトウェア上で構築した分子の構造を SMILES 記法で出力することも可能です。 |
IM-UFF
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分子構築の際、力場として IM-UFF（Interactive Modeling Universal Force Field）を実装できます。
IM-UFFでは、実際の化学反応を模した結合の形成、結合の切断をシュミレーションすることができます。 |
GROMACS interaction models
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分子構築の際、力場として GROMACS力場を実装できます。 |
Brenner interaction models
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Brenner ポテンシャルに基づいて、カーボンナノチューブ、グラフェン、および炭化水素の分子構築が可能となります。 |
Crystal Creator
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Crystal Creator では、数クリックで結晶構造モデルを構築することができます。また、CIF ファイルのインポート、ユニットセルの定義、格子欠陥や不純物の再現、結晶の切断などが可能になります。 |
主な機能
デモ版ダウンロード
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