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1Gb単位で必要なデータ量にて注文可能!
次世代シークエンシング(次世代シーケンシング)サービス
ゲノムリシークエンシング 受託解析サービス
フィルジェンでは、Novogene社との業務提携により、次世代シークエンシングサービス/ゲノムリシークエンシング受託解析サービスをご提供しております。
ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。

概要
  
ゲノムリシークエンシング受託解析サービスでは、得られたリード配列を既知のゲノム配列にマッピングさせ、SNPや挿入・欠失、その他ゲノム配列の構造変化を調べるゲノムリシークエンシング解析に対応しています。
illumina HiSeq 2500/2000
 
illumina MiSeq

サービスの仕様
使用機種
(ライブラリー種類)
illumina社 HiSeq X Ten
Paired-end reads 150bp
保証データ量 ・指定のデータ量(1-90Gb)で解析可能
作業内容 QCチェック、ライブラリー作製、シークエンス作業
納品データ(標準) FastQ file(fastq.gz)
最低注文数 1サンプル
納期(標準) 約2ヶ月
* 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルをお送りする場合は、別途送料をご請求させて頂きます。
* 電気泳動写真を必ず添付してください。
* RNase処理を行い、DNAの分解がされていないことを確認してください。
* DNase、RNaseフリーのスクリューキャップ式1.5mLチューブをご使用ください。
* ゲノムDNAは、凍結融解を出来る限り避け、4℃でTE bufferにて保存してください。長期保存の場合は、-20℃または、-80℃で保存してください。
* UVスペクトルベースの方法では、RNA、dsDNA、ssDNA、フリーの核酸などの多くの核酸も同時に検出するため、ゲノムDNAの測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
* サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

必要サンプル量

・ゲノムDNA: 1μg以上(2μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 20ng/μL以上
・O.D.260/280: 1.8-2.0
・Buffer: TE bufferまたはddH2O

(注意事項)
1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 50min.
2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
4. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認することを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
5. サンプル送付先および注意実行につきましては、「受託解析サービスの流れ」を参照してください。

NGS Variant 解析サービス(オプション) 解析例(使用ソフトウェア:CLC Genomics Workbench)

リファレンス配列にリード配列をマッピングし、SNPの存在する配列上の位置・変化した塩基の種類・変異領域をカバーするリード数、アミノ酸置換などをまとめたリストをエクセル形式で納品します。

価格

サービス内容 保証
データ量
数量 税別単価 *1 Cat.#
Plant & Animal
ゲノムリシークエンシング受託解析サービス
(HiSeq X Ten PE 150bp)
 
1Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH1
2Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH2
3Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH3
4Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH4
5Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH5
6Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH6
7Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH7
8Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH8
9Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH9
10Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH10
20Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH20
30Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH30
40Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH40
50Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH50
60Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH60
70Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH70
80Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH80
90Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH90
110Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH110
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス
(HiSeq X Ten PE 150bp)
 
110Gb 1サンプル お問合せ F-Novo-GH110X
オプション データ解析 お問合せ -
Bacteria
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス
ゲノムサイズ
の100×
1サンプル お問合せ F-Novo-BGH100×
Hungal
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス
ゲノムサイズ
の50×
1サンプル お問合せ F-Novo-FGH50×
* 110Gb以上をご希望の場合は、別途お問合せください。
* 本サービスでは、1サンプル分のQCチェック費用およびライブラリー作成費用が含まれています。マルチプレックスで解析をご希望の場合は、追加ライブラリー作成の価格が追加となります。
*1 海外へのサンプル輸送費用および納品用ハードディスク費用が別途必要です。

 
お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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