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次世代シークエンシング(次世代シーケンシング)サービス
カスタム ターゲットエンリッチメント 受託解析サービス
フィルジェンでは、Novogene社と業務提供し、次世代シークエンスサービス/カスタムターゲットエンリッチメント受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。 

概要

カスタムターゲットエンリッチメント受託解析サービスでは、お客様が希望とする遺伝子群やターゲット領域についてのエンリッチメント用カスタムキットを作製し、次世代シークエンス(次世代シーケンス)することで、その領域における多型や変異を検出することができます。

サービスの仕様

カスタムキットの種類 お問合せください。
使用機種 お問合せください。
ライブラリーの種類 お問合せください。
保証データ量 指定のcoverage、または、データ量を保証
作業内容 サンプルQCチェック, ターゲット領域の濃縮作業, ライブラリー作製, シークエンス作業
納品データ
(標準)
FastQ file(fastq.gz)
*CLC Genomics Workbench 2週間試用ライセンス付属
最低注文数 1サンプル
納期(標準) カスタムキット作成 約1.5ヶ月
シークエンス作業 約1.5ヶ月
* 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルを海外メーカーへお送りする場合は別途送料をご請求させて頂きます。

CLC Genomics Workbenchの
2週間試用ライセンスを付属
CLC bio/QIAGEN社のCLC Genomics Workbenchは、あらゆるメーカーの次世代シークエンサーのデータ解析に対応し、アセンブルやマッピングなど、様々なアプリケーションデータ解析が可能な統合解析ソフトウェアです。
詳細
 

 

【ターゲットエンリッチメントの原理と概要】
ターゲットエンリッチメントとは、次世代シークエンシング前にゲノム上の特定領域や転写産物を、高品質オリゴ(ベイト)を用いてハイブリダイゼーションさせ、選択的に対象領域を濃縮する技術です。

必要サンプル量
サンプル ・ゲノムDNA: 5ug以上
・濃度 20-500ng/ul
・O.D.260/O.D.280: 1.8以上
・O.D.260/O.D.230: 1.9以上
・Buffer: TE buffer

1. 電気泳動写真を必ず添付してください。
2. 必ずRNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. DNase, RNaseフリーのスクリューキャップ式の1.5mLエッペンチューブをご使用ください。
4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE Bufferにて保存してください。
長期保存の場合は、-20℃又は、-80℃で保存してください。
5. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

illumina HiSeq 2000



illumina MiSeq

NGS Variant 解析サービス 解析例(使用ソフトウェア:CLC Genomics Workbench)

リファレンス配列にリード配列をマッピングし、SNPの存在する配列上の位置・変化した塩基の種類・変異領域をカバーするリード数、アミノ酸置換などをまとめたリストをエクセル形式で納品します。

価格
サービス内容 税別価格 Cat.#
カスタム ターゲットエンリットメント 受託解析サービス お問い合わせ F-Novo-Custom


【関連サービス】
クリニカルシークエンスデータ解析サービス
ヒトサンプルの遺伝子変異データに対して、各種データベースのアノテーションデータやサンプルの臨床情報を対応付けし、有意な変異の検出および遺伝医学者(MD)がサインしたクリニカルレポートの作成を行います。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 www.filgen.jp
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