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TMTプロテオーム解析サービス

アイソバリックタグ標識技術は、Thompson(et al. in 2003.)氏らによって、ペプチドペアの同時同定と相対的定量化に初めて適用されました。Tandem Mass Tag(TMT)システムは、Thermo Fisher Scientific社によって、様々な種類のサンプル中のタンパク質の同定と定量のために開発されました。各TMTタグ試薬は、アミン反応性NHSエステル基、スペーサーアームおよびMS/MSレポーターで構成されています。また、セット内のアイソバリックタグ試薬は、同じ名目の親(前駆体)質量を有しています。これらのレポーターイオンは、MS/MSスペクトルの低質量領域にあり、SILACなどの代謝同位体ラベリングにおいて、困難な可能性があるセルベースまたは組織サンプルの発現変化について測定する場合などに利用することができます。本サービスは、海外業務提携先である Creative Proteomics 社(アメリカ)で実施します。


特長

アイソバリック標識 TMT (タンデム質量タグ)は、実質的にあらゆるペプチドまたはタンパク質サンプルのラベリングに使用できる最大 18 個のタグで構成されています。TMT を使用することで、マルチプレックスで分析し、機器の時間を効率的にすることができ、技術的なばらつきを制御することが可能です。TMTは、最大 18 種サンプルを標識することが可能です。各サンプルについて、MS/MS スペクトルの低質量領域における固有のレポーター質量(すなわち、126-135Da)が、ペプチドフラグメンテーション中の相対的なタンパク質発現レベルを測定するために使用されます。これは、相対的な定量プロテオミクス解析のための多重化機能を提供する。この TMT ラベル技術は、発現差プロテオーム解析や疾患のタンパク質バイオマーカーの発見に焦点を当てた研究で広く採用されています。


サービス内容

【使用機種】
本分析装置により、他の装置と比較して、より正確な定量とタンパク質同定を実現しています。


Orbitrap Fusion
TM LumosTM TribridTM System
(Thermo Fisher Scientific)

【作業内容】
1.サンプルからタンパク質調整
2.タンパク質サンプルをトリプシンで消化処理
3.消化サンプルをiTRAQまたはTMT試薬で標識
4.標識したサンプルの混合
5.強陽イオン交換体カラム(SCX Chromatography)により分画
6.高性能 nano-LC/MS/MSによるタンデム質量分析
7.データベース検索によるタンパク質同定ならびに相対定量数値化

【納品データ】
・レポート(PDF)
・データ(Excel)


必要サンプル条件

解析サンプルは、抽出タンパク質の状態でご準備ください。
組織・細胞からのタンパク質抽出、血清・血漿からのタンパク質精製・抽出につきましては、オプションとなっております。

◆タンパク質同定・発現相対定量の場合の1サンプル当たりの総タンパク質量
推奨量:>300μg、最低量:>150μg、濃度:>1μg/μL

【抽出バッファー】
推奨:8M Urea Buffer(尿素をddH2Oで溶解して8Mに調整してください。pH調整の必要が無い様に新鮮なバッファー(仕様前に調整)をご使用ください。また、プロテアーゼおよびホスフォターゼ阻害剤なども追加することを推奨いたします。)
利用可:RIPA Buffer
※その他のバッファーを使用してタンパク質抽出を実施する場合はご注意ください。

タンパク質抽出の際に使用するチューブによっては、PPまたはPEなど、チューブ材質由来のピークが検出され、ペプチドのイオン化を阻害し、データ解析に重大な影響を及ぼす可能性がありますので、ご注意ください。また、過剰にボルテックスなどをかけない様にご注意ください。
タンパク質に、界面活性剤など(ポリマー)が多量に残留していると、ポリマーがサンプル由来のペプチドのイオン化を阻害し、データ解析に重大な影響を及ぼす可能性がありますので、ご注意ください。
動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取り扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能または拒否されたりする場合もございますので、事前にお問合せください。

その他、アセトン、トリクロロ酢酸(TCA)、メタノール/クロロホルムを使用したタンパク質沈殿法によるサンプル調整法もご利用頂けます。


税別価格

サービス名 必要な総タンパク質量
(1サンプルあたり)
税別価格/サンプル Cat.#
TMTプロテオーム解析サービス 最低量>150μg
推奨量>300μg
濃度>1μg/μL
¥220,000 F-CPM-TMT-[サンプル数]
表示価格は、1サンプルの金額です。本サービスは比較解析であるため、最低2サンプル以上からの受注受付となりますので、ご注意ください。
本サービスは、海外業務提携先で実施する解析のため、上記の解析料金の他、サンプルの海外輸送費が別途発生します。


ご注意事項(必ずご確認ください)

1.解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(Creative Proteomics社)にて実施されます。

2.サンプルの送付および取り扱いに関して
2.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。十分量の砕いたドライアイスとともに梱包してください。
2.2 サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
2.3 サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
2.4 組織・細胞の場合はペレット状態にして、タンパク質の場合は凍結状態にして、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。
2.5 解析元による抽出作業の結果、解析に必要な量が確保できなかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
2.6 オプションのタンパク質抽出をご依頼頂いた場合、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。本抽出サービスは、解析に必要な量の確保を保証するものではありません。解析に必要な量が確保できない場合、サンプルの再送をお願いする場合がございます。再調整が困難な貴重なサンプルの場合などは、ご注意ください。
2.7 サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
2.8 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、またはお取り扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。
2.9 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
2.10 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
2.11 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。
 
(サンプル、QCシートおよび免責事項同意書のご送付先
 フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
 Tel: 052-624-4388 Fax: 052-624-4389 E-mail: biosupport@filgen.jp  

3.キャンセルに関して
本サービスは、海外提携先(Creative Proteomics社)での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受け出来ません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。

4.納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から3か月間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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